この治験の目的は、カイジという薬を飲む前後で、体内の分子装置の変化を調べ、がん治療に役立つ分子装置を明らかにすることです。
治験に参加するための条件は、年齢が20歳以上で80歳以下であること、そして男性でも女性でも参加できることです。年齢は、月や週、日、時間まで細かく指定されています。
この治験は、介入研究と呼ばれる種類の研究です。対象疾患は、肝臓癌、乳癌、大腸癌、泌尿器科癌、前立腺癌、膵臓癌、肺癌などの消化器癌や、癌ステムセルの存在による癌化促進と疑われる症例です。主要な結果評価方法は、mRNAライブラリーと小型RNAライブラリーのデータ分析を行い、遺伝子の発現分析を行います。また、微妙な発現結果とsmall RNAとmRNAの予測結果に基づいて、関連するsmallRNAとmRNAを同定するための統合解析も行います。
介入研究
mRNAライブラリーについては、mRNAの研究に重点を置く。データ分析は、配列決定データ処理および基本的配列決定データ品質管理、新規転写物の予測、遺伝子の差次的発現分析を含む。アップレギュレートされた遺伝子およびダウンレギュレートされた遺伝子のアノテーションおよび濃縮分析には、Gene Ontology(GO)およびKEGG経路データベースが使用される。
小型RNAライブラリーの場合、データ解析にはシーケンシングのデータプロセスと塩基配列データQC、ゲノムにわたるsmall RNA分布、rRNA、tRNA、snRNAとsnoRNAに対するアラインメント、既知のmiRNA発現パターンの構築、予測新規miRNAおよびそれらの二次構造の研究miRNAの発現パターンに基づいて、GO / KEGGアノテーションおよび濃縮だけでなく、異なる発現解析も行う。
微妙な発現結果とsmall RNAとmRNAの予測結果に基づいて、関連するsmallRNAとmRNAを同定するための統合解析を行う。
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